Deciphering Photosynthetic Protein Networks: A Crosslinking-MS Strategy for Studying Functional Thylakoid Membranes
该研究提出了一种改进的交联质谱策略，通过在保持光合电子传递活性的功能类囊体膜上引入 TMPAC 助溶剂，成功解析了拟南芥和菠菜中光合蛋白复合物的天然相互作用网络并发现了新的调控蛋白组装体。
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plant biology
299 篇论文
From Light to Acetate: How Trophic Conditions Shape Growth and Cell Cycle Progression in Chlamydomonas reinhardtii
该研究通过比较转录组分析发现，衣藻在不同营养模式（自养、混合营养和异养）下，碳代谢途径的协调调控显著影响细胞周期进程，其中混合营养模式通过增强碳通量和生物合成能力促进细胞周期早期启动和生物量积累，而异养模式则因诱导乙酸盐同化及细胞周期抑制因子表达而导致生长延迟和细胞周期启动推迟。
Prediction of late blight severity in a large panel of potato genotypes using low-altitude aerial images and machine learning methods
该研究证实，结合无人机多光谱影像与机器学习（特别是核岭回归）的方法，能够有效且客观地预测大规模马铃薯种质资源中的晚疫病严重程度，为育种选择提供了比传统视觉评估更高效、可扩展的解决方案。
FennoTraits: Dataset of plant functional traits and community composition in northern European flora
本文介绍了 FennoTraits 数据集，该数据集汇集了 2016 至 2025 年间在北欧（芬兰、挪威和瑞典）七个研究区域采集的 373 种维管植物的功能性状与群落组成数据，旨在揭示受人为干扰极低的北极苔原和北方森林生物群落中植物功能性状的分布模式。
The influence of pH on the growth and on the formation of nutrient-stress induced scum-forming blooms in cyanobacterial cultures
该研究探讨了 pH 值对蓝藻生长及盐胁迫诱导的粘液型水华形成的影响，发现这些蓝藻属于嗜碱菌，且在非缓冲培养基中生长最快，同时 pH 值显著影响粘液形成，但其具体机制不能仅通过 pH 值简单关联。
A Conserved Mechanism for Positioning Ferredoxin NADP+ Reductase at Photosystem I in Green Algae
该研究揭示了在绿藻（如莱茵衣藻）中，光系统 I 的捕光天线蛋白 Lhca4 通过其保守的 N 端α螺旋直接结合并定位铁氧还蛋白-NADP+ 还原酶（FNR），从而阐明了一种调控光合电子传递空间组织的进化保守机制。
ArchiCrop: a 3D+t architectural model driven by crop model dynamics
本文介绍了 ArchiCrop，一种受作物模型动态约束的 3D 参数化建筑模型，它通过生成在冠层尺度上等效但个体形态多样的作物构型，有效弥合了传统作物模型与功能结构植物模型之间的尺度鸿沟，从而能够量化植物建筑性状变异对光能截获等过程的不确定性影响并支持作物模型优化与理想型设计。
LipoTag: A minimal motif for live and functional imaging of plant cell membranes.
该研究介绍了一种名为 LipoTag 的最小化学基序，它通过赋予疏水性荧光探针水溶性和靶向性，使其能够穿透植物细胞壁，从而实现对活体植物细胞膜进行动态成像及膜密度、脂质有序度和氧化状态等功能性定量监测。
Cell-type-resolved transcriptional reprogramming in resistant soybean roots reveals cambial activation and early syncytium initiation upon nematode infection
这项研究通过构建抗大豆胞囊线虫品种 PI437654 感染早期的高分辨率单细胞转录组图谱，揭示了抗性机制依赖于维管形成层起源的合胞体发育受阻、细胞身份重编程及多激素协同防御等多层次、组织特异性的系统性反应。
An Arabidopsis receptor-like kinase mediates competitive plant-plant interactions
该研究鉴定出拟南芥受体激酶 ESC1（PERK13）是介导其应对早熟禾竞争的自然变异的关键基因，并揭示了其在根叶中通过不同信号通路和蛋白互作网络调控植物间竞争反应的分子机制。
A root symbiotic endophyte reprograms tomato polyamine network to confer herbivore resistance.
该研究揭示了根际共生真菌*哈茨木霉*通过重编程番茄多胺代谢网络，将多胺导向具有抗虫活性的结合态代谢物，从而显著增强植物对害虫的防御能力。
Quantifying and Characterizing the Fiber in Hass Avocados During the Ripening Process
该研究通过酶 - 化学分析法表征了哈斯牛油果在成熟过程中膳食纤维的组成与变化，发现总膳食纤维含量随成熟度增加而下降，其中果胶发生溶化和解聚，而纤维素和半纤维素则保持稳定。
Comparison of Extraction Methods for the Quantification of Phytohormones from Tomato Fruits and Leaves by LC-MS/MS
该研究通过对比三种番茄组织（果实和叶片）中植物激素的 LC-MS/MS 提取方法，发现尽管包含固相萃取的纯化步骤在某些情况下能改善基质效应或回收率，但它们很少能优于更简单的单相提取法。
Autophagy acts as a spatial organizer of cell-type-specific plant immunity
该研究通过单细胞转录组学等技术揭示，自噬在拟南芥抵御丁香假单胞菌感染中充当空间组织者，通过在保卫细胞中降解 PYL4 受体促进气孔重开，而在叶肉细胞中通过调控 EDS1-PAD4-ADR1 通路和 PTI 输出以协调免疫执行，从而阐明自噬在不同细胞类型中发挥截然相反的关键作用。
Integrated phenomic and transcriptomic analyses unveil superior drought plasticity of North African durum wheat landraces
该研究通过整合表型组与转录组分析，揭示了北非硬粒小麦地方品种（Chili 和 Mahmoudi）凭借独特的生理调节机制和基因表达程序，在长期干旱胁迫下展现出优于育种品系的抗旱可塑性，为培育气候韧性小麦提供了关键靶点。
Temperature stress resilience in polar Chlamydomonas is regulated by acclimation to light and salinity: implications for survival in a changing world
该研究首次揭示，极地衣藻在模拟气候变化的强光低盐条件下虽生长迅速，却因丧失对热胁迫的耐受力而更易死亡，表明快速生长的极地绿藻可能难以应对日益频繁的极地热浪。
Plant-parasitic nematodes produce functional mimics of plant PSK peptides to facilitate parasitism
该研究发现根结线虫通过分泌具有植物PSK功能基序的拟态肽，在感染早期操纵宿主发育途径以诱导并维持其营养吸收所需的取食位点，从而促进寄生成功。
Alleviation of arsenic (III) toxicity in rice (Oryza sativa L.) by employingmonolayer protected modified silver nanoadsorbent: Insights into growthreconditioning with antioxidant defence
该研究证实，利用单层保护修饰的银纳米吸附剂处理含砷灌溉水，能有效去除砷（III）并显著缓解其对水稻（MTU 7029）造成的毒性，通过恢复根系形态、降低氧化损伤并增强抗氧化酶活性来改善植株生长。
Harnessing within-cultivar variation to identify hidden genetic resistance using single plant-omics
该研究利用单株转录组学技术，通过分析 121 株大麦在感染禾谷镰刀菌过程中的个体差异，成功重构了早期感染调控时序，并鉴定出该高产品种内已存在的、涉及 ROS 爆发、受体激酶及 DON 解毒等关键抗病机制的遗传变异，为作物育种提供了新靶点。
OEP24.1 involved in carbon allocation is a receptor of piecemeal plastid autophagy in Arabidopsis
该研究鉴定出拟南芥中一种位于叶绿体外膜并参与碳分配的β-桶状蛋白 OEP24.1，证实了其作为受体通过 UIM 结构域与 ATG8 相互作用，从而介导包含基质蛋白的叶绿体碎片化自噬（piecemeal autophagy）并将其递送至液泡降解。